W Oddziale odbywa się diagnostyka i terapia ostrych i przewlekłych zatruć wywołanych ksenobiotykami. Oddział prowadzi także leczenie detoksykacyjne osób uzależnionych od substancji psychoaktywnych. Jako jeden z nielicznych oddziałów w Polsce posiada aparaturę i przeszkolony personel do przeprowadzania zabiegów dializy albuminowej wątroby, wspomagających leczenie zarówno ostrej, jak i przewlekłej zaostrzonej niewydolności wątroby.
Oddział Toksykologii jest przystosowany do wdrożenia procedur podtrzymywania funkcji układu krążenia i oddychania oraz wykonywania zabiegów przyspieszających eliminację trucizn egzo - i endogennych.